PhD or Postdoc position available: Vácha lab – CEITEC
Autor nivbeditor
Publikováno 2 listopadu, 2023
Project: Regulation of protein liquid droplets during transcription
Cells employ protein liquid droplets to form dynamic clusters, which function as nanoreactors or storages with the increased local concentration of specific protein components. These membrane-less organelles self-assemble based on weak protein-protein interactions of intrinsically disordered domains. However, the role of specific sequences remains elusive and the mixing between different protein droplets unexplored. This project is focused on the droplets involved in genome transcription, where posttranslational modifications control the droplet composition and regulate the transcription. Expected findings are not only important for the general knowledge but could also be useful in the design of new treatments because translocation malfunction is involved in numerous diseases including cancer. The research is strongly coupled to collaborations with excellent experimental teams and will be more closely discussed during the interview. The employed tools will contain multi-scale simulations using a wide range of advanced sampling techniques and development of protein parametrization.
Eligibility: Outstanding candidates with experience in computer simulations and with an MSc/PhD degree in the fields of biophysics, soft matter physics, physical chemistry, computational chemistry, statistical mechanics, or related fields. Experience with molecular dynamics simulations (with GROMACS, CHARMM, NAMD, AMBER, LAMMPS, etc.) or other simulation techniques (Monte Carlo, DPD, etc.) at the atomistic or coarse-grained level would be an advantage.
Computing Resources: Successful candidates will have access to local computing clusters with 2500 cores and 100 GPUs. Access to Metacentrum NGI – National Grid Infrastructure for computing (with ~20,000 cores) will be also available. Additional resources include the possibility of applying for IT4Inovations, where the group is active.
Competitive salary: depending on the position – supported by grant projects including ERC consolidator grant.
Application procedure: Applications must include a CV, with list of publications and study results, short personal statement (description of research interests, past, and plans), and the name of a person willing to provide a letter of recommendation. Applications with all this material (preferably in a single pdf) should be sent to Robert Vacha (robert.vacha@mail.muni.cz).
27 listopadu, 2023
Workshop vědeckého psaní
V sobotu 25. 11. se doktorandi z NIVB zúčastnili Workshopu vědeckého psaní, který vedl Carlos V. […]
16 listopadu, 2023
Antibiotická rezistence
Proč je antibiotická rezistence nebezpečná? Antibiotická rezistence se stala jednou z největších zdravotních výzev […]
16 listopadu, 2023
Den otevřených dveří na ÚOCHB
V rámci Týdne Akademie věd ČR proběhl na Ústavu organické chemie a biochemie v sobotu […]
10 listopadu, 2023
Národní institut virologie a bakteriologie jako platforma pro instituce působící v oblasti veřejného zdraví
V Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR se společně sešli zástupci významných institucí […]
31 října, 2023
Petr Těšina v rozhovoru ve Studiu ČT24
„Už na gymnáziu mě bavila biologie, a proto jsem šel studovat biochemii a molekulární biologii. […]
31 října, 2023
Zděněk Kameník z Mikrobiologického ústavu v médiích
Tuberkulóza, kterou způsobuje bakterie Mycobacterium tuberculosis, byla jednou z nejobávanějších nemocí historie. Má […]
16 října, 2023
PhD position available: Laboratory of Virology – BIOCEV
Project: Exploring the molecular mechanisms of activation and regulation of the innate immune response […]
Ocenění za nejlepší přednášku Ondřej Bulvas a Alžběta Dostálková získali ocenění za nejlepší […]
10 října, 2023
NIVB meeting 2023
Druhá vědecká konference NIVB Meeting 2023 se konala od 2. do 5. října 2023 v Kutné Hoře. […]
Druhý ročník NIVB meetingu se bude konat v Kutné Hoře od 2. do 5. října 2023. Na letošním […]
26 září, 2023
Metodika NIVB – brněnský workshop
Na brněnském workshopu NIVB, který se konal 14. září, se sešli odborníci z oborů bakteriologie a virologie, […]
6 září, 2023
Petr Těšina získal prestižní ERC Grant
Evropská rada pro výzkum (ERC) oznámila udělení 400 startovacích grantů mladým vědcům […]
24 srpna, 2023
Pražský workshop NIVB metodologie
Pražský NIVB Workshop, který se konal 21. srpna, sjednotil odborníky z různých oblastí, kteří sdíleli […]
18 srpna, 2023
Markéta Pimková Polidarová získala cenu za nejlepší poster
Markéta Pimková Polidarová ze skupiny Kláry Grantz Šaškové (Katedra genetiky a mikrobiologie PřF UK) […]
Rádi bychom vás pozvali na metodologické NIVB Networking workshopy v Praze a Brně. NIVB Networking […]
1 srpna, 2023
IMIC seminář (29.8.2023 v 11:00): Christopher S. Hayes
Srdečně Vás zveme na pravidelný IMIC seminář, přednášet bude: Prof. Christopher S. Hayes […]
27 června, 2023
Spoluřešitel a vědecký koordinátor NIVB Pavel Plevka se 1. července stane ředitelem významné vědecké instituce CEITEC MUNI
Ředitelem CEITEC MUNI se od 1. července z pověření rektora MU Martina Bareše stane Pavel […]
20 června, 2023
Tomáš Cihlář: Motivuje mě vědomí, že mohu ovlivnit životy lidí
„Navzdory těžkým začátkům jsem postupně cítil, že směr firmy je natolik jasný, […]
Vědci z celkem pěti elitních národních výzkumných ústavů zaměřených na oblast zdravotnictví spojí síly. […]
15 června, 2023
IMIC seminář (23.6.2023 v 11:00): Veronika K. Pettersen
Srdečně Vás zveme na pravidelný IMIC seminář, přednášet bude: Veronika K. Pettersen na […]
15 června, 2023
Symposium: Unraveling the Intricacies of Host-Pathogen Interplay: Insights into SARS-CoV-2 and Beyond
Summer BIOCEV (MINI) SYMPOSIUMThe complexity and dynamic nature of the relationship between hosts […]
18 května, 2023
Introduction of new MS instrument (31.05.2023 at 2pm)
Introduction of methods available in our service laboratory with an emphasis on advanced […]
Srdečně Vás zveme na pravidelný IMIC seminář, přednášet budou: Mgr. Michaela Novotná (lab. […]
Vědci z projektu NIVB z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR rozluštili strukturu bílkoviny […]
25 dubna, 2023
Daniel Růžek v Hydeparku Civilizace
Virolog Daniel Růžek z Parazitologického ústavu BC AV ČR byl hostem pořadu České […]
V Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR se včera sešli experti včetně vědců […]
17 února, 2023
Biologické centrum: Vědci objevili vzácné protilátky, které blokují všechny varianty SARS-CoV-2
Další informace naleznete: na tomto odkazu a tomto odkazu
Expert popisuje virus Marburg Další informace: na tomto odkazu
26 prosince, 2022
Iva Pichová oceněna cenou Josefa Hlávky
Dne 16. října byla Iva Pichová oceněna medailí Josefa Hlávky. Podívejte se na fotogalerii události […]
26 prosince, 2022
NIVB Meeting 2022
První vědecká konference NIVB Meeting 2022, která se konala od 30. 11. do 2. 12. v Kutné Hoře, byla […]
