PhD position available: Laboratory of Virology – BIOCEV
Autor nivbeditor
Publikováno 16 října, 2023
Project: Exploring the molecular mechanisms of activation and regulation of the innate immune response to BK polyomavirus
The field of sensing of DNA from pathogens or mislocalized cellular DNA by the innate immune system has progressed enormously during the last years. Although detailed structures of some of the DNA sensors and adaptor proteins were deciphered, crucial questions remain unanswered, such as the interplay between viral genomes and DNA sensors.
Our recent studies revealed that in host cells MPyV and BK genomes are sensed in cytosol by cGAS-STING pathways. However, polyomaviruses, heavily regulated the IFN responses since moderate levels of IFN and cytokines are produced.
The proposed PhD project will directly follow the above research by studying the mechanisms of modulation of the cGAS-STING pathways during BKPyV infection. For this research the student may use among others techniques: mass spectrophotometry to understand possible PTM of cGAS and STING during BKPyV infection, co-immunoprecipitation, and confocal and super-resolution microscopy will follow possible interaction between viral proteins and DNA sensors or adaptors. During the development of the project, the viral mutants and KO and KD cells will be prepared to confirm hits or
interactions.
Head of the lab and supervisor: Sandra Huerfano-Meneses (Huerfano@natur.cuni.cz)
In our lab we study at the molecular level i) interactions between viruses and host proteins that define the outcome of the infection and ii) the mechanism by which viruses are sensed by the host’s innate immune system.
We use Mouse polyomavirus (MPyV) as model virus and the human pathogen BK polyomavirus (BKPyV).
The polyomaviruses cause in their hosts primary asymptomatic infections but under conditions of immunosuppression, enhanced viral replication leads to severe diseases.
Candidate profile: MSc degree in biochemistry or molecular/cellular biology, or related field, good English, strong interest in basic research and experimental work. Experience in molecular and immunological techniques such as ELISA, western blotting, PCR, and cell culture is an advantage.
What we offer: excellent working environment, well-equipped labs in BIOCEV with state-of-the-art technologies, access, and cooperation with the core imaging and proteomics facilities at Biocev, tuition by leading experts junior and senior virologist and molecular biologist, Competitive salary of 0.5 FTE (contract as an employee) + the scholarship offered by the university.
Applications deadline in the faculty is 15.12.2023
27 listopadu, 2023
Workshop vědeckého psaní
V sobotu 25. 11. se doktorandi z NIVB zúčastnili Workshopu vědeckého psaní, který vedl Carlos V. […]
16 listopadu, 2023
Antibiotická rezistence
Proč je antibiotická rezistence nebezpečná? Antibiotická rezistence se stala jednou z největších zdravotních výzev […]
16 listopadu, 2023
Den otevřených dveří na ÚOCHB
V rámci Týdne Akademie věd ČR proběhl na Ústavu organické chemie a biochemie v sobotu […]
10 listopadu, 2023
Národní institut virologie a bakteriologie jako platforma pro instituce působící v oblasti veřejného zdraví
V Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR se společně sešli zástupci významných institucí […]
2 listopadu, 2023
PhD or Postdoc position available: Vácha lab – CEITEC
Project: Regulation of protein liquid droplets during transcription Cells employ protein liquid […]
31 října, 2023
Petr Těšina v rozhovoru ve Studiu ČT24
„Už na gymnáziu mě bavila biologie, a proto jsem šel studovat biochemii a molekulární biologii. […]
31 října, 2023
Zděněk Kameník z Mikrobiologického ústavu v médiích
Tuberkulóza, kterou způsobuje bakterie Mycobacterium tuberculosis, byla jednou z nejobávanějších nemocí historie. Má […]
Ocenění za nejlepší přednášku Ondřej Bulvas a Alžběta Dostálková získali ocenění za nejlepší […]
10 října, 2023
NIVB meeting 2023
Druhá vědecká konference NIVB Meeting 2023 se konala od 2. do 5. října 2023 v Kutné Hoře. […]
Druhý ročník NIVB meetingu se bude konat v Kutné Hoře od 2. do 5. října 2023. Na letošním […]
26 září, 2023
Metodika NIVB – brněnský workshop
Na brněnském workshopu NIVB, který se konal 14. září, se sešli odborníci z oborů bakteriologie a virologie, […]
6 září, 2023
Petr Těšina získal prestižní ERC Grant
Evropská rada pro výzkum (ERC) oznámila udělení 400 startovacích grantů mladým vědcům […]
24 srpna, 2023
Pražský workshop NIVB metodologie
Pražský NIVB Workshop, který se konal 21. srpna, sjednotil odborníky z různých oblastí, kteří sdíleli […]
18 srpna, 2023
Markéta Pimková Polidarová získala cenu za nejlepší poster
Markéta Pimková Polidarová ze skupiny Kláry Grantz Šaškové (Katedra genetiky a mikrobiologie PřF UK) […]
Rádi bychom vás pozvali na metodologické NIVB Networking workshopy v Praze a Brně. NIVB Networking […]
1 srpna, 2023
IMIC seminář (29.8.2023 v 11:00): Christopher S. Hayes
Srdečně Vás zveme na pravidelný IMIC seminář, přednášet bude: Prof. Christopher S. Hayes […]
27 června, 2023
Spoluřešitel a vědecký koordinátor NIVB Pavel Plevka se 1. července stane ředitelem významné vědecké instituce CEITEC MUNI
Ředitelem CEITEC MUNI se od 1. července z pověření rektora MU Martina Bareše stane Pavel […]
20 června, 2023
Tomáš Cihlář: Motivuje mě vědomí, že mohu ovlivnit životy lidí
„Navzdory těžkým začátkům jsem postupně cítil, že směr firmy je natolik jasný, […]
Vědci z celkem pěti elitních národních výzkumných ústavů zaměřených na oblast zdravotnictví spojí síly. […]
15 června, 2023
IMIC seminář (23.6.2023 v 11:00): Veronika K. Pettersen
Srdečně Vás zveme na pravidelný IMIC seminář, přednášet bude: Veronika K. Pettersen na […]
15 června, 2023
Symposium: Unraveling the Intricacies of Host-Pathogen Interplay: Insights into SARS-CoV-2 and Beyond
Summer BIOCEV (MINI) SYMPOSIUMThe complexity and dynamic nature of the relationship between hosts […]
18 května, 2023
Introduction of new MS instrument (31.05.2023 at 2pm)
Introduction of methods available in our service laboratory with an emphasis on advanced […]
Srdečně Vás zveme na pravidelný IMIC seminář, přednášet budou: Mgr. Michaela Novotná (lab. […]
Vědci z projektu NIVB z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR rozluštili strukturu bílkoviny […]
25 dubna, 2023
Daniel Růžek v Hydeparku Civilizace
Virolog Daniel Růžek z Parazitologického ústavu BC AV ČR byl hostem pořadu České […]
V Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR se včera sešli experti včetně vědců […]
17 února, 2023
Biologické centrum: Vědci objevili vzácné protilátky, které blokují všechny varianty SARS-CoV-2
Další informace naleznete: na tomto odkazu a tomto odkazu
Expert popisuje virus Marburg Další informace: na tomto odkazu
26 prosince, 2022
Iva Pichová oceněna cenou Josefa Hlávky
Dne 16. října byla Iva Pichová oceněna medailí Josefa Hlávky. Podívejte se na fotogalerii události […]
26 prosince, 2022
NIVB Meeting 2022
První vědecká konference NIVB Meeting 2022, která se konala od 30. 11. do 2. 12. v Kutné Hoře, byla […]
